El sustento académico del trabajo de la Red Mesoamericana de Recursos Bióticos, son los Laboratorios Regionales, estructuras colegiadas virtuales (“Academias”) que promueven la discusión disciplinaria entre especialistas de áreas afines y con las que se busca la estructuración y ejecución de proyectos específicos de investigación a nivel regional.

Originalmente se definieron en base a criterios geográficos, sin embargo, a raíz de una amplia discusión y análisis se optó por hacerlo de manera disciplinaria quedando con la siguiente clasificación.